C'est simplement le nouveau design de la Mark-VI, le MC a toujours la même armure que dans H2/H3. Cortana a modifié l'intérieur de l'armure (le HUD, la possibilité de récupérer des powers-up) mais pas l'armure en elle-même.
Halo 4 est très lié aux romans de Greg Bear (trilogie Forerunner) et de Travis (pour tout ce qui se passe après H3), on sait pourquoi le Covenant est de nouveau contre nous dans "Glasslands". Les Elites sont séparés en 2 factions : ceux dirigés par l'Arbiteur, et les Storm qui sont toujours contre l'humanité et prennent encore les Forerunners pour leurs dieux.
http://wiki.halo.fr/index.php/Elites (section "Après-Guerre")
http://wiki.halo.fr/index.php/Storm (le "nouveau Covenant" après H3)
Là il suffit juste de réfléchir, 343I n'aurait pas pris le risque de totalement la faire disparaître. Tu verras que dans H5 elle reviendra grâce à Halsey. Après, "remise à zéro" (genre qui n'a pas connu les évènements des 4 jeux) ou un renouveau grâce à une copie (ou autres) ? On verra, mais elle ne va pas être éclipsé comme ça de la trilogie.
Tu as aimé le scénario, moi aussi, mais comme je t'ai dit au dessus, aucunes incohérences